Conform Ordinului ministrului de interne nr. I/05024, începând cu data de 3 aprilie 2000, Centrul de Perfecţionare a Pregătirii Cadrelor din Comandamentul Naţional al Jandarmeriei Române îşi încetează activitatea şi se transformă în Şcoala de Aplicaţie pentru Ofiţeri a Jandarmeriei Române.
          La 1 august 2000, Şcoala de Aplicaţie se mută de la Băneasa în satul Roşu, comuna Chiajna, judeţul Ilfov.
          Prin O.U.G. nr. 183 din 3 noiembrie 2000 se ratifică Convenţia dintre Ministerul de Interne din România şi Ministerul Afacerilor Externe din Republica Franceză privind finanţarea lucrărilor de reparaţii, amenajări şi a dotării cu mobilier şi material didactic a localului Şcolii de Aplicaţie a Jandarmeriei Române.
          Printr-o finanţare bilaterală româno-franceză a fost posibilă restructurarea localului destinat Şcolii de Aplicaţie realizându-se lucrări de reparaţie capitală, amenajare şi dotare cu mobilier şi material didactic.
          La sediul Ministerului de Interne, s-a semnat în data de 06 noiembrie 2002 „Convenţia generală între Ministerul de Interne din România şi Ministerul Afacerilor Externe din Republica Franceză privind condiţiile de funcţionare a Şcolii de Aplicaţie pentru Ofiţeri "Mihai Viteazul" a Jandarmeriei Române”.
          Convenţia stabilea sistemul relaţional, statutul, drepturile şi obligaţiile personalului şi totodată mecanismele de evaluare a performanţelor Şcolii de Aplicaţie.
          În data de 13 noiembrie 2002, a fost inaugurat localul Şcolii de Aplicaţie pentru Ofiţeri „Mihai Viteazul” a Jandarmeriei Române, situat pe strada 1 Decembrie 1918 nr. 2-4, comuna Chiajna. Şcoala de Aplicaţie devenea prima instituţie cu vocaţie europeană din cadrul Jandarmeriei Române.
          Cu aceeaşi ocazie a fost dezvelit şi bustul domnitorului Mihai Viteazul al cărui nume este purtat cu onoare de noua instituţie de învăţământ a Jandarmeriei Române.
          Prin O.G. nr. 64 din 28 august 2003 a fost ratificată Convenţia dintre Ministerul Administraţiei şi Internelor din România şi Ministerul Afacerilor Externe din Republica Franceză privind condiţiile de funcţionare a Cursului Internaţional al Şcolii de Aplicaţie pentru Ofiţeri „Mihai Viteazul” a Jandarmeriei Române şi a Convenţiei de finanţare dintre Ministerul Administraţiei şi Internelor din România şi Ministerul Afacerilor Externe din Republica Franceză privind participarea părţii franceze la finanţarea întreţinerii stagiarilor de la Cursul Internaţional al Şcolii de Aplicaţie pentru Ofiţeri „Mihai Viteazul” a Jandarmeriei Române.
          Şcoala era destinată să pregătească ofiţeri români de jandarmi care au absolvit Academia de Poliţie „Alexandru Ioan Cuza”. În limita capacităţii didactice şi a spaţiului disponibil, Şcoala asigura şi desfăşurarea altor cursuri prevăzute în Graficul anual de perfecţionare a pregătirii ofiţerilor în activitate şi în rezervă. Adresându-se pentru început ofiţerilor români, Şcoala a avut ca obiectiv deschiderea către mediul internaţional, prin desfăşurarea activităţilor de pregătire în cadrul unui curs internaţional.
          Cursul Internaţional a fost destinat satisfacerii nevoilor proprii ale României şi ale acelor state legate de România şi de Franţa prin acorduri de cooperare sau printr-o convenţie specială referitoare la pregătirea stagiarilor. Capacitatea anuală de primire a Cursului Internaţional este de maximum 20 de stagiari. În afara celor 20 de locuri, eventuala participare a stagiarilor francezi urma să facă obiectul unei înţelegeri directe între comandantul Jandarmeriei Române şi directorul general al Jandarmeriei Naţionale Franceze.
          Începând cu data de 31 august 2003, colonelul Cămărăşan Petru, comandantul Şcolii de Aplicaţie, îşi încheie activitatea fiind trecut în rezervă cu drept de pensie.
          Conform ordinului comandantului Jandarmeriei Române, colonelul Vasilică Ovidiu, comandantul Centrului de pregătire a militarilor angajaţi pe bază de contract Gheorgheni, se mută la Şcoala de Aplicaţie pentru Ofiţeri „Mihai Viteazul” a Jandarmeriei Române şi este numit în funcţia de comandant.
          În data de 28 noiembrie 2003, la Şcoala de Aplicaţie a avut loc ceremonia de predare a comenzii şi a drapelului de luptă al unităţii noului comandant.
          În ziua de 24 septembrie 2003, Şcoala de Aplicaţie pentru Ofiţeri a primit diploma de excelenţă pentru meritul de a deveni o instituţie de învăţământ reprezentativă pe plan european, în domeniul siguranţei cetăţeanului şi al ordinii publice.
          Prin Ordonanţa de Urgenţă nr. 136 din 29 septembrie 2005, a fost ratificat Protocolul adiţional, semnat la Bucureşti la 13 septembrie 2005, la Convenţia dintre Ministerul Administraţiei şi Internelor din România şi Ministerul Afacerilor Externe din Republica Franceză privind condiţiile de funcţionare a Cursului Internaţional al Şcolii de Aplicaţie pentru Ofiţeri "Mihai Viteazul" a Jandarmeriei Române, semnată la Bucureşti la 11 iulie 2003 şi a Protocolului adiţional, semnat la Bucureşti la 13 septembrie 2005, la Convenţia de finanţare dintre Ministerul Administraţiei şi Internelor din România şi Ministerul Afacerilor Externe din Republica Franceză privind participarea părţii franceze la finanţarea Cursului Internaţional al Şcolii de Aplicaţie pentru Ofiţeri "Mihai Viteazul" a Jandarmeriei Romane, semnată la Bucureşti la 11 iulie 2003.
          Prin Protocolul adiţional, Cursul Internaţional a fost transformat în Curs Superior Internaţional.
          În data de 23 ianuarie 2006, a avut loc înmânarea European Label - Certificatul European pentru metode inovatoare în domeniul predării şi învăţării limbilor străine. Acest certificat este o iniţiativă a Comisiei Europene care îşi propune să evidenţieze şi să recompenseze cele mai inovatoare şi creative proiecte din acest domeniu. Şcoala de Aplicaţie a primit acest certificat pentru metoda originală de învăţare a limbii franceze, prin efectuarea pregătirii profesionale în această limbă în cadrul Cursului Superior Internaţional.
          La 11 mai 2006, a avut loc la Sfântu Gheorghe, la sediul Inspectoratului de Jandarmi Judeţean Covasna, ceremonia de inaugurare a „Catedrei de pedagogie şi psihologie aplicată” din cadrul Şcolii de Aplicaţie pentru Ofiţeri „Mihai Viteazul” a Jandarmeriei Române.
          Catedra de pedagogie şi psihologie aplicată a fost înfiinţată în scopul de a omogeniza şi eficientiza corpul de instructori militari cu rol de formatori, precum şi de a consolida corpul de psihologi din Jandarmerie, care au un rol extrem de important în susţinerea şi consilierea jandarmilor, supuşi unor condiţii de muncă solicitante, atât în plan fizic, cât şi psihic.
          Prin Ordonanţa de Urgenţă nr. 98 din 4 octombrie 2007, a fost ratificat cel de-al doilea Protocol adiţional, semnat la Bucureşti la 23 iulie 2007, la Convenţia dintre Ministerul Administraţiei şi Internelor din România şi Ministerul Afacerilor Externe din Republica Franceză privind condiţiile de funcţionare a Cursului Superior Internaţional al Şcolii de Aplicaţie pentru Ofiţeri "Mihai Viteazul" a Jandarmeriei Române, semnată la Bucureşti la 11 iulie 2003, precum şi a celui de-al doilea Protocol adiţional, semnat la Bucureşti la 23 iulie 2007, la Convenţia de finanţare dintre Ministerul Administraţiei şi Internelor din România şi Ministerul Afacerilor Externe din Republica Franceză privind participarea părţii franceze la finanţarea Cursului Superior Internaţional al Şcolii de Aplicaţie pentru Ofiţeri "Mihai Viteazul" a Jandarmeriei Române, semnată la Bucureşti la 11 iulie 2003.
          Începând cu cea de-a 5-a promoţie a Cursului Superior Internaţional (septembrie 2007 - februarie 2008), partea română asigură în totalitate finanţarea stagiarilor români, având în vedere noul statut al României de stat membru al Uniunii Europene. O modificare a Convenţiei de funcţionare a constat şi în desemnarea, de către partea română, a unui ofiţer de jandarmi cu grad superior aflat în subordinea comandantului Şcolii, în calitate de comandant al Cursului Superior Internaţional.